Южное межрегиональное управление Федеральной службы по ветеринарному и фитосанитарному надзору (далее – Управление) является территориальным органом Федеральной службы по ветеринарному и фитосанитарному надзору, осуществляющим функции по контролю и надзору в сфере ветеринарии, обращения лекарственных средств для ветеринарного применения, карантина и защиты растений, безопасного обращения с пестицидами и агрохимикатами при осуществлении государственного ветеринарного надзора, обеспечения плодородия почв, обеспечения качества и безопасности зерна, крупы, комбикормов и компонентов для их производства, побочных продуктов переработки зерна, земельных отношений (в части, касающейся земель сельскохозяйственного назначения, оборот которых регулируется Федеральным законом от 24.07.2002 № 101-ФЗ «Об обороте земель сельскохозяйственного назначения»), сфере обращения с животными в части соблюдения требований к содержанию и использованию животных в культурно-зрелищных целях, соблюдения законодательства в области виноградарства и виноделия (за исключением вопросов лицензирования, оказания государственных услуг и осуществления государственного контроля (надзора), регулируемых законодательством в области производства и оборота этилового спирта, алкогольной и спиртосодержащей продукции), функции по защите населения от болезней, общих для человека и животных, а также для реализации отдельных установленных законодательными и иными нормативными правовыми актами Российской Федерации задач и функций Россельхознадзора.
Управление в своей деятельности руководствуется Конституцией Российской Федерации, федеральными конституционными законами, федеральными законами, актами президента Российской Федерации и Правительства Российской Федерации, международными договорами Российской Федерации, нормативными правовыми актами Минсельхоза России, Положением о Федеральной службе по ветеринарному и фитосанитарному надзору, утвержденным постановлением Правительства Российской Федерации от 30.06.2004 № 327, постановлением Правительства Российской Федерации от 08.04.2004 № 201, приказами Федеральной службы по ветеринарному и фитосанитарному надзору, Типовым положением о территориальном органе Федеральной службы по ветеринарному и фитосанитарному надзору, утвержденным приказом Минсельхоза России от 04.10.2012 № 527, и положением об Управлении, утвержденным приказом Федеральной службы по ветеринарному и фитосанитарному надзору от 13.06.2019 № 581, от 30 июня 2021 года №708, от 22 августа 2022 года № 1274.
Управление осуществляет полномочия в закрепленной сфере деятельности, а также по реализации отдельных установленных законодательными и иными нормативными правовыми актами Российской Федерации задач и функций Россельхознадзора на территории Краснодарского края, Республики Адыгея, Республики Крым и г.Севастополь, Херсонской области, Запорожской области и в местах добычи (вылова) водных биологических ресурсов на участках внутренних морских вод, территориального моря, исключительной экономической зоны и континентального шельфа Российской Федерации в Черном море, а также на акватории Азовского моря, прилегающей к территории Краснодарского края и Республики Крым, Херсонской и Запорожской областей, находящихся под юрисдикцией Российской Федерации.
Непосредственно и во взаимодействии с другими территориальными управлениями Федеральной службы по ветеринарному и фитосанитарному надзору, полномочным представителем Президента Российской Федерации в Южном федеральном округе, территориальными органами других федеральных органов исполнительной власти, органами исполнительной власти Краснодарского края, Республики Адыгея, Республики Крым и г.Севастополь, Херсонской и Запорожской областей, органами местного самоуправления, правоохранительными органами, органами прокуратуры, другими органами государственной власти, общественными объединениями, организациями и гражданами.